Image via Motortion Films / Shutterstock
Cet article est republié ici avec l'autorisation de La conversation . Ce contenu est partagé ici car le sujet peut intéresser les lecteurs de Snopes, il ne représente cependant pas le travail des vérificateurs de faits ou des éditeurs de Snopes.
L'une des théories du complot qui ont entravé les tentatives de tenir les gens informés pendant la pandémie est l'idée que le coronavirus a été créé en un laboratoire . Mais la grande majorité des scientifiques qui ont étudié le virus conviennent qu'il a évolué naturellement et est passé chez l'homme à partir d'une espèce animale, très probablement une chauve-souris.
Comment savons-nous exactement que ce virus, le SRAS-CoV-2, a une origine animale «zoonotique» et non artificielle? Les réponses résident dans le matériel génétique et l'histoire évolutive du virus, ainsi que dans la compréhension de l'écologie des chauves-souris en question.
Environ 60% des maladies infectieuses connues et 75% de toutes les maladies nouvelles, émergentes ou réémergentes chez l'homme ont des origines animales . Le SRAS-CoV-2 est le plus récent des sept coronavirus trouvés chez l'homme, qui tous provenait d'animaux , que ce soit des chauves-souris, des souris ou des animaux domestiques. Les chauves-souris étaient aussi les source des virus causant Ebola, la rage, les infections à virus Nipah et Hendra, la maladie à virus de Marburg et des souches du virus de la grippe A.
La constitution génétique ou «génome» du SRAS-CoV-2 a été séquencée et partagé publiquement des milliers de fois par des scientifiques du monde entier. Si le virus avait été génétiquement modifié dans un laboratoire, il y aurait des signes de manipulation dans les données génomiques. Cela inclurait la preuve d'une séquence virale existante comme épine dorsale du nouveau virus, et des éléments génétiques évidents et ciblés insérés (ou supprimés).
Mais aucune preuve de ce genre n'existe . Il est très peu probable que les techniques utilisées pour modifier génétiquement le virus ne laissent pas un signature génétique , comme des morceaux identifiables spécifiques de code ADN.
Le génome du SRAS-CoV-2 est similaire à celui d'autres coronavirus de chauve-souris, ainsi qu'à ceux des pangolins, qui ont tous une architecture génomique globale similaire. Les différences entre les génomes de ces coronavirus montrent des modèles naturels typiques de évolution du coronavirus . Cela suggère que le SRAS-CoV-2 Evolué de un ancien coronavirus sauvage.
L'une des principales caractéristiques qui différencient le SRAS-CoV-2 des autres coronavirus est une protéine «spike» particulière qui se lie bien avec une autre protéine à l'extérieur des cellules humaines. appelé ACE2 . Cela permet au virus de s'accrocher et d'infecter une variété de cellules humaines. Cependant, d'autres coronavirus apparentés ont caractéristiques similaires , fournissant la preuve qu'ils ont évolué naturellement plutôt que d'être ajoutés artificiellement dans un laboratoire.
Les coronavirus et les chauves-souris sont enfermés dans un course aux armements évolutive dans lequel les virus sont en constante évolution pour échapper au système immunitaire des chauves-souris et les chauves-souris évoluent pour résister aux infections causées par les coronavirus. Un virus évoluera de multiples variantes, dont la plupart seront détruites par le système immunitaire de la chauve-souris, mais certaines survivront et passeront à d'autres chauves-souris.
Le «génome» du SRAS-CoV-2 a été séquencé et partagé publiquement des milliers de fois par des scientifiques du monde entier.
Studio Corona Borealis / Shutterstock
Quelques scientifiques ont suggéré que le SRAS-CoV-2 pourrait provenir d'un autre virus de chauve-souris connu (RaTG13) découvert par des chercheurs de l'Institut de virologie de Wuhan. Les génomes de ces deux virus sont similaires à 96%.
Cela peut sembler très proche, mais en termes évolutifs, cela les rend en fait significativement différent et il a été démontré que les deux partagent un ancêtre commun . Cela montre que RaGT13 n'est pas l'ancêtre du SRAS-CoV-2.
En fait, le SRAS-CoV-2 a probablement évolué à partir d'une variante virale qui n'a pas pu survivre pendant une longue période de temps ou qui persiste à de faibles niveaux chez les chauves-souris. Par coïncidence, il a développé la capacité d'envahir les cellules humaines et a accidentellement trouvé son chemin en nous, peut-être au moyen d'un hôte animal intermédiaire , où il a ensuite prospéré. Ou une forme initialement inoffensive du virus pourrait avoir sauté directement dans les humains et ensuite évoluer pour devenir nocive en passant entre les personnes.
Variations génétiques
Le mélange ou la «recombinaison» de génomes de coronavirus distincts dans la nature est l'un des mécanismes à l'origine de nouveaux coronavirus. Il y a maintenant d'autres preuves que ce processus pourrait être impliqué dans la génération de SRAS-CoV-2 .
Depuis le début de la pandémie, le virus SRAS-CoV-2 semble avoir commencé à évoluer vers deux souches distinctes , acquérir des adaptations pour une invasion plus efficace des cellules humaines. Cela aurait pu se produire grâce à un mécanisme connu sous le nom de balayage sélectif, par lequel des mutations bénéfiques aident un virus à infecter plus d'hôtes et à devenir ainsi plus fréquents dans la population virale. Il s'agit d'un processus naturel qui peut finalement réduire la variation génétique entre les génomes viraux individuels.
Le même mécanisme rendrait compte de la manque de diversité vu dans les nombreux génomes de SARs-CoV-2 qui ont été séquencés. Cela indique que l'ancêtre du SRAS-CoV-2 aurait pu circuler dans les populations de chauves-souris pendant un temps considérable . Il aurait alors acquis les mutations qui lui ont permis de passer des chauves-souris à d'autres animaux, y compris les humains.
Il est également important de se rappeler qu'environ une sur cinq de toutes les espèces de mammifères sur Terre sont des chauves-souris, certaines ne se trouvant que dans certains endroits et d'autres migrant sur de grandes distances. Cette diversité et répartition géographique Il est difficile d'identifier de quel groupe de chauves-souris le SRAS-CoV-2 est originaire.
Il y a des preuves que les premiers cas de COVID-19 se sont produits en dehors de Wuhan en Chine et n'avaient aucun lien clair avec le marché humide de la ville où la pandémie aurait commencé. Mais ce n’est pas la preuve d’une conspiration.
Il se pourrait simplement que des personnes infectées aient accidentellement introduit le virus dans la ville, puis sur le marché humide, où les conditions fermées et occupées augmentaient les chances de propagation rapide de la maladie. Cela inclut la possibilité que l'un des scientifiques impliqués dans la recherche sur le coronavirus de la chauve-souris à Wuhan soit sans le savoir infecté et ramener le virus d'où vivaient leurs chauves-souris soumises. Cela serait toujours considéré comme une infection naturelle et non comme une fuite de laboratoire.
Ce n'est que grâce à une science robuste et à l'étude du monde naturel que nous pourrons vraiment comprendre l'histoire naturelle et les origines des maladies zoonotiques comme le COVID-19. Cela est pertinent car notre relation en constante évolution et nos contacts croissants avec la faune augmentent le risque de nouvelles maladies zoonotiques mortelles chez l'homme. Le SRAS-CoV-2 n'est pas le premier virus que nous ayons contracté chez les animaux et ne sera certainement pas le dernier. 
Polly Hayes , Maître de conférences en parasitologie et microbiologie médicale, Université de Westminster
Cet article est republié à partir de La conversation sous une licence Creative Commons. Lis le article original .
